2025年第13週の定点当たり報告数は1.85（患者報告数9,093）となり、前週の定点当たり報告数1.98よりも減少した。都道府県別では長野県（4.00）、富山県（3.92）、沖縄県（3.84）、秋田県（3.46）、新潟県（3.43）、岩手県（3.39）、栃木県（3.09）、福島県（3.07）、和歌山県（2.52）、群馬県（2.45）の順となった。全国47都道府県中、20都道府県では前週の報告数よりも増加し、27都道府県では前週の報告数よりも減少した。
　定点医療機関からの報告をもとに、この1週間に、定点医療機関以外の医療機関を含む全国の医療機関を受診した患者数を推計すると、約6.3万人（95%信頼区間：5.6～7万人）となり、前週の推計値（約6.5万人）よりも減少した。年齢別では、0～4歳が約0.6万人、5～9歳が約0.9万人、10～14歳が約1.3万人、15～19歳が約0.8万人、20代が約0.6万人、30代が約0.6万人、40代が約0.6万人、50代が約0.4万人、60代が約0.3万人、70歳以上が約0.2万人となっている。また、2024年第36週以降これまでの累積の推計受診者数は約1033.3万人となった。
　全国の保健所管轄区域のうち、警報レベルを超えている保健所管轄区域はなかった。また、注意報レベルを超えている保健所管轄区域は4か所で、4都道府県に分布していた。
　基幹定点医療機関から報告された、インフルエンザによる入院報告数は125例であり、前週（122例）から増加した。40都道府県から報告があり、年齢別では1歳未満(3例）、1～4歳（10例）、5～9歳（8例）、10代（11例）、20代（3例）、30代（2例）、40代（2例）、50代（7例）、60代（13例）、70代（12例）、80歳以上（54例）であった。
　国内のインフルエンザウイルスの検出状況をみると、直近5週間（2025年第9週～2025年第13週）ではB型が28件（45％）、AH3亜型が22件（35%）、AH1pdm09が12件（19%）の順であった。
　詳細は国立健康危機管理研究機構感染症情報提供サイト（https://id-nfo.jihs.go.jp/diseases/a/influenza/020/flu-map.html）を参照されたい。