2016年第20週の定点当たり報告数は0.48（患者報告数2,357人）となり、前週の定点当たり報告数0.68よりも減少した。都道府県別では沖縄県（2.31）、青森県（2.17）、岩手県（2.00）、福島県（1.78）、鹿児島県（1.63）、佐賀県（1.56）、秋田県（1.43）、山形県（1.21）、新潟県（1.09）、北海道（1.08）の順となっており、6都府県で前週の報告数よりも増加がみられ、39道府県で前週の報告数よりも減少がみられた。
　全国の保健所地域で警報レベルを超えているのは0箇所であり、注意報レベルを超えている保健所地域は1箇所（1県）であった。
　定点医療機関からの報告をもとに、定点以外を含む全国の医療機関をこの1週間に受診した患者数を推計すると約3万人（95%信頼区間：2〜3万人）となり、前週の推計値（約4万人）よりも減少した。2015年第36週以降これまでの累積の推計受診者数は約1,613万人となった。
　基幹定点からのインフルエンザ患者の入院報告数は27例であり、前週（41例）から減少した。15府県から報告があり、年齢別では0歳（2例）、1〜9歳（6例）、40代（1例）、50代（1例）、60代（4例）、70代（3例）、80歳以上（10例）であった。
　国内のインフルエンザウイルスの検出状況をみると、直近の5週間（2016年第16週〜2016年第20週）ではB型の検出割合が最も多く、次いでAH1pdm09、AH3亜型の順であった。
　詳細は国立感染症研究所ホームページ（http://www.nih.go.jp/niid/ja/flu-map.html）を参照されたい。