2013/2014年シーズンのインフルエンザの定点当たり報告数は2013年第43週以降増加が続いている。2014年第2週の定点当たり報告数は5.51（患者報告数27,100）となった。都道府県別では沖縄県（19.90）、鹿児島県（9.28）、岐阜県（8.91）、高知県（8.71）、和歌山県（8.10）、熊本県（8.06）、大分県（7.81）、宮崎県（7.66）、佐賀県（7.64）、静岡県（7.27）の順となっており、全47都道府県で増加がみられた。
　定点医療機関からの報告をもとに、定点以外を含む全国の医療機関をこの1週間に受診した患者数を推計すると約34万人（95%信頼区間：31万人〜36万人）となり、30代が約6万人、20代、40代がそれぞれ約5万人、0〜4歳、5〜9歳がそれぞれ約4万人、50代が約3万人、10〜14歳、15〜19歳、60代、70歳以上がそれぞれ約2万人の順となっている。
　全国の保健所地域で警報レベルを超えているのは2箇所（大阪府1、沖縄県1）、注意報レベルを超えている保健所地域は53箇所（23道府県）と共に増加した。
　基幹定点からのインフルエンザ患者の入院報告数は292例であり、2014年第1週（164例）より増加した。46都道府県から報告があり、年齢別では0歳（17例）、1〜9歳（93例）、10代（9例）、20代（4例）、30代（5例）、40代（9例）、50代（14例）、60代（33例）、70代（46例）、80歳以上（62例）であった。
　2013年第36〜2014年第1週の18週間では、インフルエンザウイルスの検出は、AH3亜型（A香港型）の割合が最も多く、次いでAH1pdm09、B型の順となっている。詳細は国立感染症研究所感染症疫学センターホームページ（http://www.nih.go.jp/niid/ja/iasr-inf.html#graph）を参照されたい。