2013年第49週の定点当たり報告数は0.67となり、第43週以降増加が続いている。都道府県別では佐賀県（2.69）、鹿児島県（2.37）、山口県（2.01）、高知県（2.00）、大分県（1.78）、富山県（1.50）、沖縄県（1.33）、北海道（1.21）、栃木県（1.20）、滋賀県（1.13）、埼玉県（1.10）の順となっており、38都道府県で前週よりも増加がみられた。
　注意報レベルを超えた保健所地域は3か所（北海道2、高知県1）認められている。警報レベルを超えた保健所地域は存在していない。
　基幹定点からのインフルエンザ患者の入院報告数は36例であり、第48週（44例）より減少した。25都道府県から報告があり、年齢別では0歳（3例）、1〜9歳（10例）、10代（2例）、20代（1例）、30代（2例）、50代（3例）、60代（4例）、70代（2例）、80歳以上（9例）であった。
　2013年第36〜48週の13週間では、インフルエンザウイルスの検出は、AH3亜型（A香港型）の割合が最も多く、次いでAH1pdm09、B型の順となっている。詳細は国立感染症研究所感染症疫学センターホームページ（http://www.nih.go.jp/niid/ja/iasr-inf.html#graph）を参照されたい。