感染症発生動向調査によれば、全国レベルでの定点当たり報告数は第29週は0.16と更に減少した。都道府県別では、沖縄県（6.10）、青森県（1.60）、宮崎県（0.54）、岩手県（0.41）の順となっている。
注意報レベルのみを超えている保健所地域0であり、警報レベルを超えている保健所地域は1箇所（沖縄県）のみとなった。
2005年第36週以降これまでに、PCR検査結果を含めたインフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型1,339（25.6%）、AH3（A香港）型3,418（65.3%）、B型477件（9.1%）の計5,234報告されている。