感染症発生動向調査によれば、全国レベルでの定点当たり報告数は第23週は0.83と低下した。都道府県別では、沖縄県（16.8）、北海道（3.3）、岩手県（3.1）、秋田県（2.4）、青森県（2.0）の順となっている。
注意報レベルのみを超えている保健所地域は8箇所（北海道2、岩手県1、滋賀県1、鹿児島県1、沖縄県3）であり、警報レベルを超えている保健所地域1箇所（北海道1）である。沖縄県本島地域のインフルエンザの患者発生報告数は3週連続で大きな増加がみられている。
2005年第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型1,318件（25.9%）、AH3（A香港）型3,404件（67.0%）、B型357件（7.0%）の計5,079件が報告されている。第16週以降は、B型の検出の割合が高い。