2005年第52週は感染症発生動向調査からは、全国レベルでの定点当たり報告数は5.3となり、インフルエンザの報告数は増加が続いている。都道府県別では岡山県（32.7）、宮崎県（25.9）、香川県（14.4）、福岡県（13.4）、佐賀県（11.7）が多い。注意報レベルのみを超えている保健所地域は80（26都府県）存在し、警報レベルを超えている保健所地域は11（6府県）存在している。
第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型46件、AH3（A香港）型170件、B型2件の計218件が報告されている。