2005年第50週は感染症発生動向調査からは、全国レベルでの定点当たり報告数は1.88となり、インフルエンザの流行期に入ったと考えられる。注意報レベルのみを超えている保健所地域は23（15府県）存在し、警報レベルを超えている保健所地域は2（2県）存在している。都道府県別では岡山県（定点あたり報告数13.1）、山梨県（8.1）、岩手県（6.5）、山形県（5.8）、宮崎県（5.6）、群馬県（4.2）、熊本県（4.2）、鹿児島県（4.2）が多い。
第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型36件、AH3（A香港）型124件、B型1件の計161件が報告されている。