2005年第49週は感染症発生動向調査からは、全国レベルでの定点当たり報告数は0.91と、前週の0.41の2倍以上になった。まだ警報レベルを超えている保健所地域はないが、北海道、宮城県、大阪府、岡山県、熊本県の5県で注意報レベルを超えた保健所地域が存在している。 都道府県別では山梨県（定点あたり5.7）、岡山県（4.6）、山形県（4.4）、岩手県（3.6）、群馬県（2.6）、熊本県（2.6）からの報告が多いが、1.0を超えているのは15府県にものぼっている。
第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型31件、AH3（A香港）型72件の計103件が報告されている。インフルエンザの全国的な流行は近付いていると思われる。